En las levaduras la PGAM es una proteína tetramérica pero en mamíferos se presenta como un dímero de dos subunidades casi idénticas de 32kDa, presenta 3 isozimas dependiendo de qué subunidades forman la molécula (MM, BB o MB). El tipo MM se encuentra exclusivamente en el músculo liso de 253a.a, el tipo MB en el músculo cardíaco y esquelético y el tipo BB resto de tejidos ambas de 254aa. Los genes para las tres isoformas se encuentran en el cromosoma 10. Su deficiencia causa glucogenosis tipo X con alteraciones que afectan principalmente el músculo esquelético.