Es una metaloenzima que se encuentra en todos los tejidos capaces de efectuar fermentación. Posee tres subunidades denominadas α, β, y γ, que pueden combinarse en dímeros que son isoenzimas (αα, αβ, αγ, ββ y γγ). La 2-PG se enlaza al sitio activo por medio del grupo fosforilo al aminoácido 159 y la segunda subunidad, en su propio aminoácido 159, se separa del sustrato por una molécula de agua. Así, la primera subunidad realiza la deshidratación de 2-PGA, mientras que la segunda subunidad lleva la reacción inversa. Es una proteína con 436aa, cuyo gen tiene la localización 12 p13.