La reacción de la PKLR es irreversible y sitio importante de regulación, la cual se regula distintamente según el tejido en que trabaje. En hígado se inhibe en presencia de ATP y Acetil-CoA y se activa de nuevo ante aumento de la concentración de FBP y PEP. En ayuno el aumento de glucagón, se activa la cascada del AMPc, que produce la activación de proteínas quinasas que fosforila la PKLR, al estar fosforilada se inactiva y no se sintetiza piruvato. Al disminuir el glucagón se interrumpe su fosforilación, activándose lo que restablece la síntesis de piruvato a partir de fosfoenolpiruvato.